但是正史中的记载并不一定可靠。早在唐代，就有人敢冒杀头的危险提出异议。据唐代僧人彦《唐护法沙门法琳别传》记载，高僧法琳曾直言驳斥李世民的出身，他说：“琳闻拓跋达，唐言李氏，陛下之李，斯即其苗，非柱下陇西之流也。”认为李氏实出鲜卑族拓跋达宗族，而不是陇西望族李氏之后，法琳的说法应比较可信。一则僧人不打诳语，不会无端提出这样重大的问题。二则没有确切证据，他是不敢拿自己生命开玩笑的。《宋书·柳元景传》、《新唐书·宗室世系表》对李氏一族另有相关记载。李渊祖父李虎有兄名“起头”，有弟名“乞豆”，李起头之子名“达摩”，这些名字显然带有异族色彩，并非为汉族人所常用。而李氏的先祖在北魏时，做过弘农太守，名叫李初古拔，四字姓名在汉族中除复姓外极其少见，由此不难推断，唐宗室李氏应出自胡族。

对新、旧唐书中记述的李氏家族渊源，经现代学者考证，存在疏漏。李渊自称出自陇西李氏望族，其祖父李虎因为这个原因被封为陇西郡公。而李渊四世祖李熙、曾祖李天锡却出自河北赵郡李氏。陇西李氏与赵郡李氏本来没有必然联系，北魏时，以赵郡李氏为望族，西魏时改封陇西李氏为望族。宗族郡望应是固定不变的，李氏家族却频繁更换郡望，可见，他们并不是真正的汉族血统出身。随意更改郡望，无非是想要获得较高的政治地位，他们的这种行为彻底暴露了其胡族的真实身份。

传世的唐代画家阎立本《步辇图》，细致描绘了李世民的容貌。他身姿丰伟，神态安详，两颊和下巴的胡须卷曲着，与西域胡族男子有着近似的相貌特征。从生理学来看，这多少与其胡族血统有点关系。除此，李世民的性格、行为、擅长、嗜好等，也集中体现了其胡族出身。首先，他贵为一代明君，却在“玄武门之变”中残忍杀害亲兄弟，这与胡人的“嗜血成性”一脉相承。其次，他精于骑射，在戎马倥偬中度过了大半生生涯，显然是继承了塞外民族的优良传统。再次，他嗜爱骏马，生前有良驹万匹，死后也要在墓前设立“昭陵六骏”陪侍左右，一定程度上显露了游牧民族所共有的“恋马”情结。种种迹象都表明了李世民的胡族身份。

另外，还可以找到一些旁证来证明李世民出自胡族。据《旧唐书·李元婴传》载，李世民侄孙滕王李涉“状貌类胡而丰硕”，明显具有异族人的特征。又唐代刘饣束《隋唐嘉话》说，隋末王世充部将单雄信曾呼李世民之弟李元吉为“胡儿”，这不应是讽刺挖苦之语，而是揭了李世民家族的老底儿，令他特别恼火。最突出的例证是李氏家族中部分人的婚姻，显著地带有胡人婚俗遗风。如唐高宗李治在太宗死后，纳其父才人武则天为昭仪，讲号宸妃。唐明皇也不顾众人反对，公然纳其儿媳杨玉环为贵妃。这些行为，用汉族的礼仪来看有违伦理，不符合道德规范，但以胡人眼光观之，并无不妥之处。南宋理学家朱熹曾批评说：“唐源流于夷狄，故闺门失礼主事不以为异。”道明了此中缘由。还有唐太宗李世民的昭陵，据学者考证也带有胡族的痕迹。陵前原有的个“番西”雕像虽已不知去向，但他们应该与墓主有一定联系。昭陵的骏马石刻为中国历代帝陵所独有，它代表了一种特定的陪葬习俗，这种习俗只能来自于塞外民族。综上言之，这些旁证进一步证明了唐太宗的身上确实流淌着胡族人的血液，他的民族属性应该是胡族而不是汉族。

开创大唐基业的李世民，竟然是胡人血统，似乎令人不可思议，因此招致了一些人的反驳。他们认为，《步辇图》中李世民的肖像，尽管胡须有些卷曲，但这是画家的夸饰之笔，不一定是真实情形。以此来判定李世民为胡族血统，未免太武断。唐太宗弑兄夺位，这是不争的事实，但这种残忍手段并非他所独创，早在春秋时期，就已有了杀父弑兄、夺占王位的丑行，而两汉、魏晋南北朝时为了抢夺皇位，父子相残、兄弟互戕之事也时有发生。这些人中，既有汉人，也有胡人，如果仅以夺位者所用手段的毒辣凶残来断定其族属，那难免有以偏概全之嫌。因此，也不能用“玄武门”之变中唐太宗的所作所为来认定他是少数民族后裔。

历代开国君主在未取得帝位之前，大都是能征善战的猛将，如东汉光武帝刘秀、晋武帝司马炎等。骑马作战是他们应具备的本领，唐太宗自然也不例外。李世民出身于豪门，其父兄皆能骑射，作为胸有大志的李家二公子，注重学习兵法，喜欢骑马射箭，所以，根据李世民擅长骑射而臆断他是胡人也是不足取的。爱马并非游牧民族的独特风俗，在汉族中也不乏其例，如项羽有马名“骓”，项羽视之如生命，即使在他兵败乌江时，也不忍心将其杀害，而将它送给了乌江亭长。汉武帝也酷爱名马，当李广利在攻灭大宛向其进奉“汗血”宝马时，他惊呼其为“天马”。可见，“昭陵六骏”陪葬石刻也不能充分证明唐太宗为塞外民族后裔。至于李世民后代的乱伦行为，这在性关系比较自由的唐代算不上丑闻，而且也很少提到伦理的高度认识这点。往往倒是人的情欲战胜了伦理，李治、李隆基均为美色所迷惑，全然忘记了道德人伦，才做出令后人耻笑的荒唐事来，这与其胡族血统没有必然联系。由此可见，唐太宗李世民根本不是什么胡人后裔，他还是彻头彻尾的汉族人。

然而，结合魏晋南北朝时的史实，完全认定李世民是汉族人，似有不妥之处，因而有人提出了一种折衷的观点，认为他是汉族与胡族的混血儿。

其一，李世民先祖并非凉武昭王李之后，因而也就不是西汉“飞将军”李广的后人，他的真正祖籍应在今河北赵县。唐高祖李渊自称祖居陇西狄道是为了抬高自己的门第，以提升自己的政治地位。自北魏孝文帝改革以来，其统治地区允许胡汉通婚，李氏又与鲜卑族杂居在一起，因此李世民身上应流淌着胡人的血液。还有人认为，北魏时期，太行山以东地区有五大望族王、李、崔、郑、卢，其中李姓为鲜卑族中一大姓氏，是汉化后取的汉姓。《旧唐书·高祖本纪》也有李渊祖父李虎在北魏时被赐姓大野氏的记载，由此推断李氏先祖应为鲜卑贵族大野部的姓氏。《旧唐书》故弄玄虚，画蛇添足，无意中漏了马脚。这么来看，李世民成了胡族血统，但根据北魏异族可以通婚的法令，他的身上又涌动着汉族人的血液。

其二，对于李渊的血统，学术界仍存在着三种观点：河北赵郡破落贵族、鲜卑族大野部和老子李耳后裔。目前尚没有足够证据说明他不是汉族。即使是汉族，李渊也不是纯种，他身上仍有胡人血统。其母独孤氏为鲜卑族，显然李渊是混血儿。他又娶妻窦氏，据窦氏言，其父窦毅托言是东汉窦章之后，汉末章子亡奔匈奴，被封为部落大人，实际上是匈奴人，最起码也是匈奴化的汉人。窦毅妻宇文氏系出匈奴，那么窦氏必然具有胡族血统，她与李渊生的儿子李世民当然是混血儿了。这不是虚妄之谈，而是千真万确的事实。